[柯哀]灰色的光芒（双结局—BE版 持续更新）

序章0
0.历时三年，在红方付出了惨痛的代价之后，黑衣组织，终于被击垮了。灰原由于是被迫留在组织，再加上追击组织时立下的功劳，脱离了罪名。可APTX4869解毒剂的研发却迟迟没有进展，组织并没有留下任何的资料——全部销毁了。以至于连宫野艾莲娜留下的给志保19岁和20岁的录音带里也没能提供多少有用的信息。江户川柯南和灰原哀就这样一路从小学念到了国中。在这种不得已的情况下，FBI也为两人********。
在得知柯南就是新一，而且他再也变不回来以后，兰答应了本堂瑛佑的求婚，尽管兰深知自己是爱着新一的……可道德再也不能允许他们在一起了。柯南就是新一。每每想到这点，兰就觉得自己像个傻瓜。明明新一就在身边，尽管自己那么怀疑过柯南的身份，却总是被他用各种手段糊弄过去，为什么新一就是不肯告诉自己真相呢？小兰和柯南最后告别的地方是机场，以小兰姐姐和江户川柯南的身份，而并非以兰和新一。尽管柯南百般挽留，但兰已经决心要走了。拥抱过后，小兰在毛利夫妇的招呼下登上了飞机。柯南可以清晰看到兰脸上的泪痕，她哭红的双眼，可自己却无能为力……他和兰的缘分，到此为止了吧。兰走后，柯南在口袋里翻出了一张他和兰在游乐场的合照，一定是在刚刚拥抱的时候兰放进去的。相片的背后有一行字[再见了，新一]，柯南鼻子一酸，几滴眼泪从面颊滴落，落在相片上，这是兰留给他最后的纪念了。
毛利一家随堂本先生搬去了美国，兰终于离开了日本这个令她痛苦的地方，她在这里为一段没有结果的爱恋，浪费了太多青春岁月。同去的还有铃木园子，兰最好的朋友，她当然放不下她，况且园子也要和京极真在美国订婚了。安室先生在对决中牺牲，CIA和FBI在结束了对组织的调查后也没有留在日本的理由，于是秀一也带着真纯和玛丽离开了。
这算什么呢，众叛亲离吗?江户川柯南时常这样想，也许这就是代价吧。不过还好他还有灰原哀，那个不可爱的哈欠女，有着和他共同的命运的女孩，两人一起出生入死的次数几年来已经数不清了，而现在柯南也搬回了工藤宅，两人每天一起上下学。江户川很庆幸自己没有失掉和灰原的羁绊。还有博士，那个总爱搞一些没有的发明，出无聊谜语的老人家，还有对自己有着别样情感的步美；知识面很广的光彦；爱吃鳗鱼饭的元太。父母也偶尔会从美国飞过来探望自己，这就足够了。
还有那位来自大阪皮肤黝黑的友人服部平次，两人总是一起破案，配合十分默契，私下也在进行名侦探之间的较量。不过最近服部倒是给柯南带来了一件奇怪的案子，信中的委托人要求他去调查一起灵异事件，这让服部很摸不着头脑。他只好大老远跑来米花町向柯南寻求帮助，和他一起处理这个案子，而我们的故事，也要由此开始了。