北朝时期的杜氏

（杜锡）累迁太子中舍人。性亮直忠烈，屡谏愍怀太子，言辞恳切，太子患之。后置针着锡常所坐处毡中，刺之流血。
——《晋书·杜锡传》
相比于南朝的京兆杜氏的遭遇，处于十六国北朝时期的京兆杜氏，也进入了困难时期。杜预的儿子杜锡曾经做过赵王司马伦的治书侍御史。西晋“八王之乱”期间，赵王司马伦和孙秀出兵杀了贾后一党，牵连甚广，作为贾谧二十四友之一的杜斌，也就是杜预的从兄，也被杀。原本杜锡能够求情救下杜斌，但是因为他曾经拒绝和孙秀交往而遭到了孙秀的嫉恨，他连自己都泥菩萨过河，自然没有办法救他的亲戚。
司马越专权时，京兆杜概密谋起兵造反，结果事情泄露，被杀。
后赵式微时，原先被迁于枋头（河南浚县）的氏族首领苻健带着族人返回关中。当时京兆杜洪占据长安，自称是晋征北将军、雍州刺史，招兵买马，很多人归顺他。他联合司马勋与苻健进行血战，结果兵败，被部下斩 杀。
京兆杜氏遭受重挫的情况直到前秦时期才得到好转。史书记载，苻坚死后，幽州刺史王永等大臣劝丕继承大位，并宣檄州郡征讨慕容垂、姚长等人，当时，各地方纷纷举兵响应，而京兆杜敏也领兵数万参与。
在北朝从政的还有杜预的孙子杜胄一房。杜胄在苻坚的前秦王朝担任官职，而其子孙也奋发有为，在北朝各个政权担任官职。《杜铨传》记载：“杜铨，京兆人，晋征南将军预五世孙也。祖胄，苻坚太尉长史。父疑，慕容垂秘书监，仍侨居赵 郡。”
北魏时期，拓跋焘外祖父死于濮阳，拓跋焘准备派人将其灵柩运回其故乡邺城，便询问周边大臣，谁可担大任。崔浩则直接推荐杜铨，他说京兆杜铨，家在赵郡，是杜预之后，是现在所有杜氏中最有名望的人。于是，拓跋焘便任命杜铨为宗正，让他和在魏郡生活的杜超一起带着杜豹的灵柩返回邺城。从此以后，杜铨和杜超两房杜姓便合谱。
除了以上京兆杜氏在北朝各个政权担任官职外，还有杜果、杜整两房，他们在战乱时代也从政，过着胆战心惊的生 活。